Urodziła się 21 września 1817r. w rodzinie mieszczańskiej w Nysie. Mając 25 lat dołączyła ze starszą siostrą Matyldą oraz Franciszką Werner do prywatnego stowarzyszenia religijnego, które zapoczątkowała w Nysie tercjarka franciszkańska Klara Dorota Wolff. Te cztery dziewczęta postanowiły 27 września 1842 r po mszy św. w nyskim kościele św. Jakuba i św. Agnieszki złożyć akt oddania Najświętszemu Sercu Pana Jezusa zobowiązując się nieść pomoc potrzebującym bez względu na wyznanie, narodowość i płeć. Żyjąc we wspólnocie na wzór zgromadzeń zakonnych nosiły zwykły szary i niepozorny strój, którego kolor zdobył im przydomek „Szare Siostry”. Po nieudanej próbie połączenia „Stowarzyszenia Szarych Sióstr” ze Zgromadzeniem Sióstr Boromeuszek doszło do rozwiązania stowarzyszenia. Maria Merkert postanowiła mimo ogromnych trudności wznowić działalność Stowarzyszenia pod nazwą św. Elżbiety 19 listopada 1850 roku. Biskup wrocławski uznał stowarzyszenie za kongregację kościelną po 9 latach owocnej działanośći. W 1959 roku została wybrana pierwszą przełożoną generalną Zgromadzenia Sióstr św. Elżbiety mimo, że dopiero rok później złożyła śluby zakonne. 7 czerwca 1871 r. papież Pius IX udzielił aprobaty temuż zgromadzeniu. Pod jej kierownictwem powstało 90 domów zakonnych, 12 szpitali i wiele domów opieki.
Zmarła w opinii świętości 14 listopada 1872 r. w Nysie.
30 września 2007 r. w Nysie odbyła się beatyfikacja, którą zatwierdził papież Benedykt XVI.